Ecological speciation of a generalist organism: population genomics of adaptation and biogeography of Ligula intestinalis tapeworms
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-04676S
Alternative language
Project name in Czech
Ekologická speciace generalistického organismu: populačně-genomická analýza adaptací a biogeografie tasemnice Ligula intestinalis
Annotation in Czech
Vznik ekologicky podmíněných adaptací v sympatrických populacích organismů a jejich dopad na genetickou diferenciaci a vznik nových druhů patří mezi klíčová témata v evoluční biologii a ekologii. Rozšíření nových metod umožnilo využití genomických dat na populační úrovni, což poskytlo řadu nových poznatků ale i několik kontroverzních zjištění (např. odhalení vnitřních genomických procesů, které produkují podobný genetický obraz jako ekologická speciace). Tato zjištění vyžadují testování na nových speciačních modelech. Díky jejich jasnému ekologickému vymezení jsou paraziti užitečným modelem v evolučním výzkumu, protože umožňují testovat adaptační hypotézu speciace prostřednictvím analýzy hostitelské specifity. Navržený projekt bude zkoumat otázky spojené s ekologickou speciací pomocí sekvenace genomu tasemnice Ligula intestinalis, která má široké spektrum hostitelů a globální rozšíření. Genom pak bude rozšířen o genetickou mapu, která umožní detailní analýzu jak vnitřních genomických procesů, tak diferenciace spojené s adaptacemi na nové hostitele a vznikem nových linií parazitů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Jun 30, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
6,635 thou. CZK
Public financial support
6,575 thou. CZK
Other public sources
60 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK