The evolutionary and functional relationship between LEDGF/p75 and Pdp3
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-14360S
Alternative language
Project name in Czech
Evoluční a funkční vztah mezi LEDGF/p75 a Pdp3
Annotation in Czech
Lens Epithelium Derived Growth Factor/p75 (LEDGF/p75 nebo PSIP1) je transkripční koaktivátor zodpovědný za lokalizaci dalších faktorů do blízkosti aktivně přepisovaných genů. Přesto, že je atraktivním terapeutickým cílem pro HIV-1 a MLL leukemii, není fyziologická role tohoto proteinu objasněna. V rámci projektu budeme sledovat evoluční původ LEDGF/p75 a budeme podrobně studovat jeho interakce v méně složitém systému pomocí strukturní biologie. Na základě bioinformatické analýzy jsme zjistili, že protein Pdp3 z kvasinkového NuA3b histon acetyltransferázového komplexu, je pravděpodobným orthologem LEDGF/p75. Využijeme biofyzikální techniky a biomolekulární NMR spektroskopi pro podrobnou strukturní charakterizaci Pdp3 interakcí. Tato informace poslouží lepšímu pochopení buněčných funkcí LEDGF/p75, což bude mít dopad na vývoj specifických inhibitorů LEDGF/p75-MLL1 interakce pro léčbu MLL leukémie.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Minor problems occurred only with the first of the three aims. The second aim resulted in a practically domestic publication in Science . The result of the work on the third aim is currently under review at the NSMB - also very nice.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
8,226 thou. CZK
Public financial support
7,422 thou. CZK
Other public sources
804 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK