Correction of molecular mechanics potentials of drug-like molecules by property map
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-16857S
Alternative language
Project name in Czech
Zpřesnění molekulárně mechanických potenciálů léčivům podobných molekul metodou property map
Annotation in Czech
Simulace molekulové dynamiky má značné možnosti uplatnění při vývoji léčiv a v dalších aplikovaných oborech. Komplikací pro rutinní využívání této metody je její výpočetní náročnost a nedostatečná přesnost molekulárně mechanických potenciálů, zvláště pak pro obecné organické molekuly, mezi nimiž jsou hledána nová léčiva. Pro zpřesnění těchto potenciálů navrhujeme přístup, který je inspirován výsledky, které jsme získali při vývoji nových simulačních technik. Přístup zahrnuje výběr referenčních konformací molekuly, přesný výpočet jejich energií a korekci molekulárně mechanického potenciálu s použitím těchto referenčních konformací. Celý postup je možné automatizovat a tak získat zpřesněné molekulárně mechanické potenciály pro velký počet molekul.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10403 - Physical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The goals of the project were successfully achieved with 5 impacted publications and 2 proceeding contributions. The articles were published in specialized journals with a limited importance for other fields. The relatively large number of students involved in the project is evaluated positively. The financial costs were spent within the rules. The project is rated as "accomplished".
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 12, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
4,519 thou. CZK
Public financial support
4,087 thou. CZK
Other public sources
417 thou. CZK
Non public and foreign sources
15 thou. CZK