Tetrastranded arrangements of DNA and their interactions
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-17063S
Alternative language
Project name in Czech
Čtyřřetězcová uspořádání DNA a jejich interakce
Annotation in Czech
Čtyřřetězcové formy nukleových kyselin, jmenovitě guaninové kvadruplexy a cytozinové i-motivy, jsou díky svým četným regulačním funkcím in vivo ve středu zájmu současné molekulární biologie. Naše pozorování v souladu s literaturou naznačují, že konformační rozpětí čtyřřetězcových struktur je mnohem širší, než bylo očekáváno podle standardních vyhledávacích algoritmů. Tyto „méně zřejmé“ čtyřřetězcové formy vznikají díky různým lokálním substitučním efektům v řetězcích DNA a jako takové mohou představovat velice jemnou regulaci buněčných procesů. S pomocí biofyzikálních a molekulárně biologických metod budeme v projektu charakterizovat tyto méně zřejmé čtyřřetězcové konformace, jejich interakce a funkčních projevy. Identifikace mírných změn v primární struktuře, které zásadně, ať pozitivně či negativně, ovlivňující strukturu sekundární, má mimořádný význam v dramaticky se rozvíjející oblasti genomových manipulací.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Jun 30, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
5,702 thou. CZK
Public financial support
5,681 thou. CZK
Other public sources
21 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK