All
All

What are you looking for?

All
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Bottom-up unraveling of biophysical determinants of ORP5/8 mediated lipid transport using in vitro reconstitution and model membranes

Project goals

Membrane homeostasis requires organized transport of lipids from the endoplasmic reticulum (ER) to target membrane. Oxysterol binding protein related proteins (ORPs) represent a family of lipid transfer proteins, two members of which, ORP5/8, attracted high attention recently. Experiments performed in live cells implied ORP5/8 in the control of phosphatidylserine and phosphatidylinositol 4-phosphate content in plasma membrane. Studies carried on different proteins of the family indicate that the two cargo lipids are exchanged for one another. Yet, the biophysical understanding of the exchange and its fine regulation is missing. Thus, we will reconstitute the transport in the bottom-up manner into model membranes, explore broader repertoire of lipid cargoes and their affinities for the lipid binding domain (ORD). We will also address the molecular mechanism of the exchange, particularly coupling between the ORD domain and the membrane targeting PH domain, the contribution of the ER resident phosphatase Sac1 and the role of tethered membrane topology.

Keywords

lipid transportlipid transfer proteinsORPfluorescencemicroscopyfluorescence crosscorrelation spectroscopyFRETlarge unilamellar vesiclesgiant unilamellar vesiclesmembrane tetherprotein dynamics

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 23 (SGA0201900001)

  • Main participants

    Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    19-18917S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Studium biofyzikálních faktorů lipidového transportu proteiny ORP5/8 pomocí in vitro rekonstituce do modelových membrán

  • Annotation in Czech

    K udržení stálého a specifického složení buněčných membrán je třeba organizovaného transportu lipidů z místa jejich tvorby, endoplazmatického retikula, do cílové membrány. Proteiny příbuzné proteinu vázajícímu oxysterol (ORPy) jsou rodinou lipidových přenašečů, jejímž dvěma členům, ORP5/8, je poslední dobou věnována vysoká pozornost. Studium těchto proteinů v buňkách nasvědčuje tomu, že ovlivňují úroveň fosfatidylserinu a fosfatidylinositolu 4-fosfátu v plazmatické membráně. Na základě výzkumů provedených na příbuzných proteinech lze předpokládat, že tyto lipidy jsou transportovány výměnným mechanizmem. Biofyzikální princip této výměny a jeho regulace nejsou známy. Našim cílem je rekonstrukce transportního procesu do modelových membrán, prozkoumání širšího spektra potenciálně přenášených lipidů a jejich afinit k transportní doméně (ORD). Ve výsledku se zaměříme na objasnění molekulárního mechanizmu výměny, konkrétně spřažení mezi ORD doménou a PH doménou rozpoznávající cílovou membránu, roli fosfatázy Sac1 a roli topologie procesu odehrávající se v membránových přemostěních.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    10608 - Biochemistry and molecular biology

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CE - Biochemistry
    EB - Genetics and molecular biology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    Some of the project aims have been successfully completed. During the project 3 publications were produced, one of them indirectly and another one directly related to the project. The published articles are in good peer-reviewed journals and in one case the researcher is a corresponding author. The panel positively evaluate the involvement of students in the project.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2019

  • Realization period - end

    Dec 31, 2021

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    May 12, 2021

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP22-GA0-GA-U

  • Data delivery date

    Jun 29, 2022

Finance

  • Total approved costs

    3,705 thou. CZK

  • Public financial support

    3,705 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK

Basic information

Recognised costs

3 705 CZK thou.

Public support

3 705 CZK thou.

100%


Provider

Czech Science Foundation

OECD FORD

Biochemistry and molecular biology

Solution period

01. 01. 2019 - 31. 12. 2021