The effect of transmembrane domains of integral proteins on dynamic organisation of the plasma membrane of T lymphocytes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-11-0459
Alternative language
Project name in Czech
Vliv transmembránových domén integrálních proteinů na dynamickou organizaci plazmatické membrány T lymfocytů
Annotation in Czech
Intaktní plazmatická membrána je jednou ze základních podmínek pro aktivaci T buněk imunitního systému. Našim cílem je studium vlivu transmembránových domén čtyř vybraných T buněčných signálních proteinů, CD3e, CD3z, LAT a PAG-85, na organizaci membrán. Vliv peptidů odvozených z těchto transmembránových domén na fyzikální vlastnosti lipidů bude sledován v modelových membránách. Podobně bude analyzován vliv lipidového složení membrány na difúzi těchto peptidů. V živých T buňkách pak porovnáme difuzi a seskupování fluorescenčních fuzních proteinů obsahujících nativní (celé) proteiny s variantami obsahujícími jenom jejich transmembránové domény. Tak můžeme odlišit membránové změny způsobené transmembranovou doménou od těch, způsobených převážně interakcemi ostatních částí proteinů s jejich okolím. Výsledky tohoto projektu mají přispět k poznání mechanizmů odpovědných za dynamickou organizaci buněčných membrán, tolik potřebnou pro správnou signalizaci buněk.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project focused on verification of the simulation of the function of transmembrane domains on membrane protein localization. Results were published in three original, two review papers, and one book chapter. Goals of the project were mostly satisfied.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
8,812 thou. CZK
Public financial support
8,812 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK