Structure-function relationships in MN/CA IX, a human tumor-associated cell adhesion protein
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vztahy struktury a funkce u MN/CA IX, bílkoviny buněčné adheze, spojené s lidskými karcinomy
Annotation in Czech
MN/CA IX je povrchový buněčný protein spojený s několika typy lidských karcinomů. Vykazuje vazbu k buněčným povrchovým receptorům a neesenciální aktivitu anhydrasy kyseliny uhličité. Z hlediska buněčné transformace se zdá být relevantní proteoglykanová (PG) část MN/CA IX protože vektory obsahující jen samotný PG insert zůstávají funkčními. Úplný MN/CA IX protein má 459 aminokyselin a je složen ze signálního peptidu (SP), peptidoglykanové domény (PG), domény homologní s anhydrasami kyseliny uhličité (CA), transmembránové domény (TM) a krátké intracelulární domény (IC). Vazba monoklonální protilátky (mAb) M75 ruší vazbu buněk k MN/CA IX a příslušný epitop je lokalizován v PG oblasti. Základ tumorigenicity MN/CA IX je připisován buněčné adhezi a transdukci signálu, ale příslušné molekulární mechanismy zůstávají nejasné. Od vyřešení trojrozměrné struktury MN/CA IX proteinu ("konkrétního cíle jedna") lze očekávat, že poslouží k odhalení podrobností interakce mezi PG doménou a známými nebo
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Crystal structures of free Fab M75 and of complex Fab M75 + peptide M (PGEEDLPGEEDL) were solved and coordinates of the complex were deposited at PDB database (PDBId=1Y06). The amino acid sequences of variable domains of M75 heavy and light chains, neede
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
3,392 thou. CZK
Public financial support
1,668 thou. CZK
Other public sources
1,724 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK