All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Genomics of replicated cichlid diversification in rivers: The role of hybridization in adaptive radiation of Neotropical pike cichlids (Crenicichla)

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 23 (SGA0201900001)

  • Main participants

    Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    19-20012S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Genomika replikované diverzifikace cichlid v říčních systémech: Vliv hybridizace na adaptivní radiaci u neotropického rodu Crenicichla

  • Annotation in Czech

    V rámci projektu budeme zkoumat roli hybridizace v procesu adaptivní radiace u neotropického rodu Crenicichla. Ke studiu bude použit náš unikátní model dvou nepříbuzných říčních druhových hejn s pěti analogickými ekoformami, k jejichž vývoji došlo procesem replikované diverzifikace a které představují odlišné potravní typy. Na základě celogenomového sekvenování 250 jedinců budeme analyzovat introgresivní toky genů s cílem rozlišit příčinnou hybridizaci ve smyslu syngameonové hypotézy nebo hypotézy hybridního hejna od recentních introgresí a ancestrálního polymorfismu. V genomech budeme rovněž vyhledávat specifické oblasti s vysokou mírou diferenciace ("genomické ostrovy speciace"), které mohou být projevem diverzifikující selekce. Pro dosažení kompletního využití celogenomových dat osekvenujeme a sestavíme referenční genom některého druhu rodu Crenicichla.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    10613 - Zoology

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    EG - Zoology

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2019

  • Realization period - end

    Jun 30, 2022

  • Project status

  • Latest support payment

    Apr 1, 2022

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP23-GA0-GA-R

  • Data delivery date

    Jun 26, 2023

Finance

  • Total approved costs

    7,832 thou. CZK

  • Public financial support

    7,832 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK