Genomics of replicated cichlid diversification in rivers: The role of hybridization in adaptive radiation of Neotropical pike cichlids (Crenicichla)

Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-20012S

Project name in Czech
Genomika replikované diverzifikace cichlid v říčních systémech: Vliv hybridizace na adaptivní radiaci u neotropického rodu Crenicichla
Annotation in Czech
V rámci projektu budeme zkoumat roli hybridizace v procesu adaptivní radiace u neotropického rodu Crenicichla. Ke studiu bude použit náš unikátní model dvou nepříbuzných říčních druhových hejn s pěti analogickými ekoformami, k jejichž vývoji došlo procesem replikované diverzifikace a které představují odlišné potravní typy. Na základě celogenomového sekvenování 250 jedinců budeme analyzovat introgresivní toky genů s cílem rozlišit příčinnou hybridizaci ve smyslu syngameonové hypotézy nebo hypotézy hybridního hejna od recentních introgresí a ancestrálního polymorfismu. V genomech budeme rovněž vyhledávat specifické oblasti s vysokou mírou diferenciace ("genomické ostrovy speciace"), které mohou být projevem diverzifikující selekce. Pro dosažení kompletního využití celogenomových dat osekvenujeme a sestavíme referenční genom některého druhu rodu Crenicichla.

R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10613 - Zoology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EG - Zoology

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023

Similar projects(10)