The evolution, diversity and hybridization of Acarosporaceae in southwestern North America: an integrative study using classical taxonomy, phylogenetics, and genomics
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM2022LU001
Main participants
Česká zemědělská univerzita v Praze / Fakulta životního prostředí
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
-
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce, diverzita a hybridizace čeledi Acarosporaceae v jihozápadní oblasti Severní Ameriky: Integrativní studie za využití klasické taxonomie, fylogenetiky a genomiky
Annotation in Czech
Druhy v poušti jsou v nejnižších nadmořských výškách Severní Ameriky již vzácné a téměř zcela chybí. S oteplováním ovzduší a suchem jim hrozí vymírání. V tomto projektu bude naší hlavní oblastí výzkumu biodiverzity jihozápadní část Severní Ameriky. Cílem je nasbírat co nejvíce různorodého materiálu a prozkoumat biodiverzitu Acarosporaceae v jižní Kalifornii a v Utahu, určit materiál z Nevady a BYU herbáře. Naším hlavním cílem je objasnění mezidruhových vztahů čeledi Acarosporaceae, popis nových druhů a studium evolučních procesů mezi vybranými zástupci skupiny Acarospora strigata v jihozápadní části Severní Ameriky za použití klasické taxonomie a nejnovějších molekulárních metod. V geneticky velmi variabilní skupině A. strigata pravděpodobně zde dochází k hybridizaci mezi druhy nebo/a introgresi. Plánujeme genomickou studii k objasnění procesů evoluce ve skupině s americkým spoluřešitelským týmem pod vedením S. Leavitta (BYU, Utah). Zajistíme komplexní náhled na evoluční procesy ovlivňující diverzitu této skupiny. Poskytneme referenční genom Acarospora peltastica a budeme testovat proces hybridizace přibližně u 100 vzorků skupiny A. strigata. Spoluřešitelský tým bude mít na starosti celogenomové sekvenování a uspořádá dva workshopy (2023 a 2024) týkající se analýzy genomických dat a přístupů studia hybridizace. Výsledky budeme publikovat v prestižních impaktovaných časopisech. Plánujeme 11 IF publikací a 1 Scopus publikaci. Zrevidujeme klíče k rodům a druhům čeledi a popisy taxonů pro správnou identifikaci druhů v pouštích jihozápadu Severní Ameriky pro využití vědeckou lichenologickou veřejností. Typové položky budou zaslány do herbářů v České republice (PRM), BYU-C v Utahu a Santa Barbara Botanical Garden (SBBG) v Kalifornii a přístupné badatelům. Naše výsledky budeme prezentovat na českých i zahraničních konferencích a světovém lichenologickém kongresu IAL10, Terst v Itálii. V rámci grantu plánujeme zapojit studenty na různých úrovních studia.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10612 - Mycology
OECD FORD - secondary branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 7, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MSM-LU-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
11,039 thou. CZK
Public financial support
11,039 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK