Using DNA to generate light
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-20989S
Alternative language
Project name in Czech
Produkce světla pomocí DNA
Annotation in Czech
In vitro selekce byla již v minulosti využita k vytvoření široké řady motivů nukleových kyselin, které mají potenciál usnadnit základní výzkum. V tomto návrhu popisujeme postup izolace a optimalizace deoxyribozymových kináz, které produkují světlo. Ve srovnání se stávajícími metodami nabízejí tyto deoxyribozymy řadu výhod: snadnou manipulaci ve srovnání s radioaktivitou a vyšší citlivost než při použití fluorescence. Senzory vytvořené z deoxyribozymových kináz produkujících světlo lze navíc dále efektivně optimalizovat pomocí in vitro selekce. Abychom demonstrovali funkčnost metody, vytvoříme pomocí racionálního designu alosterické deoxyribozymy závislé na přítomnosti ATP. In vitro selekce bude poté použita k vytvoření senzorů pro různé třídy biologicky důležitých ligandů. Tyto senzory by měly být důležitým nástrojem pro širokou paletu aplikací, jako jsou detekce proteinů či vysoko-kapacitní testy enzymových inhibitorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The goal, which was to develop and optimize a nucleic acid-based photogenerating system by combining experimental and theoretical approaches, was achieved: the developed oligonucleotide efficiently catalyzes chemiluminescence reaction of an available substrate. The results, which were produced with the contribution of the students, are original and were published in top tier journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 12, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
7,170 thou. CZK
Public financial support
6,894 thou. CZK
Other public sources
276 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK