The RNA polymerase amount in mycobacteria - how it is regulated and how it affects the cell
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-07473S
Alternative language
Project name in Czech
Množství RNA polymerázy v mykobakterích - jak je řízeno a jak ovlivňuje buňku
Annotation in Czech
Mykobakteriální RNA polymeráza (RNAP) je cílem rifampicinu, důležité látky používané pro léčbu tuberkulózy způsobenou Mycobacterium tuberculosis. Rezistence na rifampicin je ovlivněna hladinou RNAP v mykobakteriálních buňkách. V minulosti jsme objevili malou RNA s názvem Ms1, která váže RNAP u M. smegmatis. Zjistili jsme, že Ms1 zvyšuje množství RNAP během stacionární fáze růstu, kdy jsou podmínky nepříznivé. Nyní bychom chtěli popsat faktory, které regulují expresi RNAP, odhalit mechanismus, jak Ms1 zvyšuje hladinu RNAP a odpovědět, zda Ms1 přispívá k rezistenci na rifampicin. Zaměříme se na neobvykle dlouhou 5´UTR rpoB-rpoC genů kódujících dvě hlavní RNAP podjednotky. Na základě předběžných údajů se 5´UTR RpoB-RpoC mRNA skládá do struktury podobné Ms1 a silně váže RNAP. Předpokládáme, že RNAP reguluje svou vlastní expresi a Ms1 se účastní tohoto procesu. Dále budeme studovat obecný účinek množství RNAP na mykobakteriální transkriptom. To by mohlo odpovědět na to, proč RNAP v mykobakteriích reguluje své vlastní množství.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The long-term goal of the project was to understand how the MS1 small RNAs work and answer if they could be used to develop specific "RNA antibiotics" targeting individual bacterial species. It was proposed that these RNAs could be modified and used as “RNA antibiotics” that will target only bacterial pathogens and not the other bacteria in the human microbiome. Results were published in 4 papers.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Jun 30, 2023
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-U
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
10,104 thou. CZK
Public financial support
10,104 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK