Novel mechanisms of gene regulation via (super)enhancers and spatial chromatin organization during blood lineage differentiation

Project name in Czech
Nové mechanismy genové regulace pomocí (super)enhancerů a 3D organizace genomu v krvetvorné diferenciaci
Annotation in Czech
Superenhancery jsou nově objevené klastry mnohočetných genově regulačních oblastí (enhancerů), které hrají zásadní úlohu v aktivaci tkáňově specifických genů, určení buněčné identity a indukci diferenciace. Superenhancery zprostředkují 3D interakci genomu nezbytnou pro správnou aktivaci genů a narušení této interakce hraje klíčovou úlohu v karcinogenezi. PU.1 je transkripční faktor, nezbytný pro normální krvetvorbu. Přesné hladiny PU.1 stimulují diferenciaci krvetvorných buněk do různých linií a narušení hladin PU.1 vede k leukemogenezi. Cílem projektu je identifikovat nové mechanismy regulace genové exprese zprostředkované kooperací vícečetných regulačních sekvencí - superenhancerů a jimi zprostředkované 3D organizace chromatinu během PU.1 krvetvorné diferenciace a leukemogeneze. Projekt je založen na hluboké analýze regulačních sekvencí, in vitro rekonstituci, mutování a funkčním testování jednotlivých složek superenhancerů a analýze 3D struktury DNA a dále na analýze a manipulaci afinity PU.1 vazebných míst, za využití PU.1 transgeních buněčných linií a myší.

R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
May 21, 2024

Similar projects(10)