Noninvasive physical monitoring of molecular interactions in regulation of gene expression
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
202/05/0628
Alternative language
Project name in Czech
Neinvazivní fyzikální diagnostika molekulárních interakcí při regulaci genové exprese
Annotation in Czech
Budou rozvinuté účinné optické metody citlivého sledování biomolekulárních interakcí v malých objemech vzorků bez nutnosti zavádění molekulárních značek do interakčního místa a budou aplikované při studiu těch interakcí nukleová kyselina - protein, kteréhrají významnou roli v regulaci genové exprese a v "antisense" terapii. U vybraných štěpících a regulačních enzymů bude sledována tvorba, struktura a biochemická aktivita jejich komplexů s nukleovými kyselinami. Metodický vývoj bude zahrnovat (i) technické a matematické řešení přesných měření Ramanova rozptylu v nmol množstvích, (ii) konstrukci senzorového systému vysokého rozlišení s až osmi v reálném čase měřícími kanály, založeném na rezonanci povrchových plasmonů, (iii) vypracování komplexních interakčních modelů pro biomolekuly zahrnujících i vliv hydrodynamických podmínek, (iv) přípravu modifikovaných oligonukleotidů s různou strukturou cukr - fosfátové páteře.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
BH - Optics, masers and lasers
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10306 - Optics (including laser optics and quantum optics)<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In accordance with the project aims, advanced techniques and experimental procedures have been developed and optimized for sensitive monitoring those interactions of nucleic acids (NA) that play important role in gene expression and its regulation in oli
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
4,695 thou. CZK
Public financial support
4,695 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK