Structure and Properties of Modified Components of Nucleic Acids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-24880S
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a vlastnosti modifikovaných složek nukleových kyselin
Annotation in Czech
Nukleární magnetická rezonance (NMR) je jednou z nejpoužívanějších, nejefektivnějších a nejuniverzálnějších analytických metod při získávání strukturních informací včetně intermolekulárních interakcí. V tomto projektu navrhujeme studovat strukturu a vlastnosti modifikovaných složek nukleových kyselin (MCNA), tj. modifikovaných bází nukleových kyselin, nukleosidů a nukleotidů pomocí experimentální NMR (NMR s vysokým rozlišením v kapalné a pevné fázi), výpočtu NMR parametrů (jaderné stínící konstanty a interakční konstanty jak pro izolované molekuly tak pro krystaly) a molekulového modelování. Konkrétně navrhujeme studovat a) protonaci-deprotonaci a tautomerii MCNA, b) vnitřní dynamiku bází nukleových kyselin, a c) konformaci cukerné části MCNA. V experimentální NMR bychom se rádi zaměřili na dynamicky se rozvíjející oblasti, jako je NMR krystalografie nebo aplikace zbytkových dipolárních kaplinků (RDC) pro malé molekuly.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CC - Organic chemistry
CEP - another secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10403 - Physical chemistry<br>10406 - Analytical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The research team has achieved significant results in NMR spectroscopy of nucleic acids components modified in nucleobase or sugar moiety. Development of NMR as a tool for nucleic acid study is useful for a wider scientific community interested in these compounds. Participation of students is appreciated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 10, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
6,006 thou. CZK
Public financial support
6,006 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK