Inhibition of the HIV protease mutants - a new approach in the computer based drug design
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Inhibice mutantů HIV proteázy - nový přístup v počítačovém návrhu inhibitorů
Annotation in Czech
Léčba infekce způsobené virem HIV je v posledních letech komplikována faktem, že proti dosud nejúčinnějším léčivům - inhibitorům HIV-1 proteázy (PR) vytváří virus resistentní mutanty a zabraňuje tak jejich působení. Domníváme se, že návrh nové generace inhibitorů musí odrážet několik důležitých základních faktů - i) inhibitor nesoutěží se substrátem o vazebné místo tak jak je toto interpretováno z krystalových struktur komplexů HIV-1 PR s inhibitorem, ale o vazebné místo v apoenzymu a tento fakt je společný pro širší spektrum inhibovaných proteáz, ii) mutace ovlivňují vazbu inhibitoru k enzymu přímo a nepřímo, iii) vlastnosti aktivního místa v apoenzymu pro nemutovanou i mutovanou formu enzymu se významně liší ve srovnání s charakterem aktivního místav uzavřené konformaci pro oba druhy molekul, iiii) existuje velké množství experimentálních dat jejichž analýza je pro návrh nového typu inhibitorů nutná. Cílem předkládaného projektu je vypracování nové obecné teoretické metody pro návrh inhibitor
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CD - Macromolecular chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10404 - Polymer science<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Projekt vhodně spojoval výpočetní metody racionálního návrhu inhibitorů HIV-1 proteázy s experimentálně získanými kinetickými daty, charakterzujícími vazbu inhibitorů jak k mutantní tak standardní formě HIV-1 proteázy. Podařilo se zjistit, které struktur
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
2,289 thou. CZK
Public financial support
1,955 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK