Chiroptical properties, conformation and dynamical behaviour of the middle sized oligopeptide having structural domains with different flexibility
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Chiroptické vlastnosti, konformace a dynamické chování středně velkého oligopeptidu se strukturními doménami o výrazně odlišné flexibilitě
Annotation in Czech
Vibrační cirkulární dichroismus (VCD) je s největší pravděpodobností schopen poskytovat detailní informace o trojrozměrné struktuře a dynamickém chování středně velkých molekul (např. oligopeptidů), které je zpravidla obtížné jinými technikami studovat.Máme v úmyslu prozkoumat tuto možnost užitím několika typů oligopeptidů, jejichž společným rysem je buď přítomnost oddělených oblastí, které se liší konformací nebo dynamikou, případně takových molekul, v nichž oblasti s rigidním uspořádáním jsou propojeny flexibilní spojkou. Takové molekuly poskytují možnost aplikace ab initio technik k interpretaci dat vibrační optické aktivity technikou přenosu tenzorů molekulárních vlastností. Jako hlavní cíl jsme zvolili tak zvaný "hinge pepti" (fragment lidského imunoglobulinu igGl), v jehož molekule jsou dva rigidní řetězce oktapeptidu (bohaté na prolin) propojeny pohyblivými disulfidickými můstky. Jako modelové systémy budeme rovněž zkoumat molekuly dioxopiperazinů obsahující bazické aminokyseliny,
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
CC - Organic chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Spectroscopic analysis of the hinge peptide conformation and flexibility resulted in a consistent and reasonably complete picture. The peptide stays in a left handed helical conformation of the Polyproline II type and rather drastic intervention have to
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
4,126 thou. CZK
Public financial support
1,187 thou. CZK
Other public sources
2,939 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK