Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
Annotation in Czech
Předpokládá se, že zástupci některých kmenů bakteriofágů (virů bakterií), případně jejich specifické proteiny a peptidy, mohou sloužit jako nové účinné prostředky v léčbě bakteriálních infekcí. Pro racionální vývoj fágové terapie, bez nežádoucích účinkůsoučasných antibiotik, je třeba nalézt vztah mezi požadovanými biologickými vlastnostmi vhodných fágů a jejich genomem a proteomem. K dosažení tohoto cíle je nutné vyvinout novou technologii pro rychlou a spolehlivou analýzu fágové molekulární struktury.Vtomto projektu bude vyvinut trojrozměrný separační systém pro analýzu fágů. V první fázi použijeme pro separaci celkové směsi fágových proteinů mikropreparativní kapilární elektroforézu s vysoce citlivou detekcí na bázi laserem indukované fluorescence(LIF) s nekovalentním značením. Získaný fingerprint poslouží k odhalení diferencí proteinového obsahu fágů a k řízení automatického sběru frakcí. Frakce bodou následně štěpeny trypsinem imobilizovaným na stěnách sběrných jamek. V závěrečném kroku budou
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Comparison of DNA sequences of polyvalent staphylococcal phage 812, its mutants and related phages led to discovery and consequently to detail characterization of mutation changes in phage genome, which are related directly to their host range. Major res
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
7,442 thou. CZK
Public financial support
3,890 thou. CZK
Other public sources
3,552 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK