Conjugates of nucleobases with metal complexes as electroactive markers. Application of labelled oligonucleotides in electrochemical DNA sensors
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/05/0043
Alternative language
Project name in Czech
Konjugáty nukleobází s komplexy kovů jako elektroaktivní značky. Využití značených oligonukleotidů v senzorech pro hybridizaci DNA
Annotation in Czech
Projekt bude zaměřen na syntézu nových typů konjugátů purinových a pyrimidinových bází a nukleosidů s komplexy kovů (např. ferrocen, komplexy bipyridinu či fenanthrolinu s různými přechodnými kovy atd.) spojených přes konjugovaný linker. Takto označené nukleosidy budou převedeny na chráněné fosforamidity a použity v syntéze oligonukleotidů. Bude studováno elektrochemické chování značených oligonukletidů v jejich jednořetězcové a dvouřetězcové formě (včetně duplexů s řetězci obsahujícími bodové mutace).Cílem bude najít systém, jehož elektrochemické vlastnosti budou výrazně ovlivněny tvorbou duplexu DNA, a využít jej při vývoji senzorů pro hybridizaci DNA. Předpokládáme, že se vliv interakcí mezi páry bazí v dvoušroubovici DNA přenese přes konjugovaný systém na marker (komplex kovu). Potenciální markery budou také studovány teoretickými výpočetními metodami a vypočtené ionizační potenciály srovnávány s experimentálními daty. Výpočty budou využity při racionálním designu nových markerů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
CG - Electrochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The goals of the project have been fulfilled and significantly extended. Methodology for arylation and alkynylation of nucleobases and nucleosides by cross-coupling reactions and synthesis of conjugates of nucleobases and nucleosides with Ru and Os compl
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
2,967 thou. CZK
Public financial support
2,967 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK