a-N-Acetylgalactosaminidase and a-galactosidase-structural and functional characterisation, use in synthesis of biologically important glycoconjugates
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/05/0172
Alternative language
Project name in Czech
a-N-Acetylgalaktosaminidasa a a-galaktosidasa -strukturální a funkční charakterizace, jejich aplikace v synthese biologicky aktivních glykokonjugátů
Annotation in Czech
Bude vytvořena enzymová knihovna fungálních extracelulárních a-N-acetylgalaktosaminidas a a-galaktosidas screeningem u fungálních sbírkových kmenů. Podrobně bude studována a-galaktosidasa z houby Talaromyces flavus, která byla již dříve identifikována jako velmi vhodná pro enzymovou syntézu glykosidů stericky bráněných alkoholů. Bude optimalizována produkce enzymu, bude provedena její puri-fikace se zvláštním zřetelem k výskytu isoenzymů. Bude proveden scale-up a imobilizace enzymu . Protein(y) budou charakterizovány z funkčního a proteomického hlediska. Na základě AK a DNA sekvenování bude provedeno srovnání s existujícími sekvencemi a krystalovými strukturami a vytvořen model in silico, který bude využit pro modelování interakcí s modifikovanými substráty. Enzym(y) budou využity pro syntézu a modifikaci glykokonjugátů (xenotransplantační antigen, AB aglutinogeny) a pro studie s modifikovanými substráty (glykosylazidy, glykosylfluoridy). Dále bude proveden screening na a-N-acetylgalaktosaminidasu
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Large screening of rare enzyme ?-N-acetylgalactosaminidase was performed and as the best producer Aspergillus niger was identified and the production medium and the conditions were optimized. The enzyme was purified, characterized, sequenced and recombin
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
3,586 thou. CZK
Public financial support
3,586 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK