Construction of novel functional nucleic acids for applications in chemical biology, catalysis and self assembly.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203-09-0317
Alternative language
Project name in Czech
Konstrukce nových funkčních nukleových kyselin pro aplikace v chemické biologii, katalýze a samoskladbě.
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na vývoj nové efektivní metodiky konstrukce funkcionalizovaných DNA duplexů a oligonukleotidů ve dvou krocích. Prvním krokem bude přímá modifikace nukleosid trifosfátů pomocí cross-coupling reakcí ve vodě. Následovat bude enzymatická inkorporace modifikovaných nukleosid trifosfátů do DNA polymerasami (např. metodami primer extension nebo PCR). Bude rovněž rozvíjena alternativní metodika spočívající v připojení substituentu cross-coupling reakcemi halogenovaných oligonukleotidů. Oběmatypy metodik budeme konstruovat funkční nukleové kyseliny nesoucí různé typy funkčních skupin aplikovatelné např. v chemické biologii, samoskladbě, nanotechnologiích a katalýze.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
CA - Inorganic chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10402 - Inorganic and nuclear chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
During the project, an original methodogical approach to construct fluorescently labeled as well as crosslinking oligonucleotides and DNA was developed, which allow to study interactions with proteins and/or their covalent modification. Results were published in a form of 18 original research papers, majority of them in excellent journals. Goals of the project were fully accomplished.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
9,985 thou. CZK
Public financial support
9,985 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK