Translation fidelity during biochemical and morphological differentiation in streptomyces
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Věrnost translace v průběhu morfologické a biochemické diferenciace u streptomycet
Annotation in Czech
Cílem projektu je vytvořit reportérový systém pro měření nonsence suprese na bázi genů kódujících bakteriální luciferázu a provést s ním měření přesnosti translace in vivo v průběhu morfologické a biochemické diferenciace u vybraných streptomycetových kmenů a od nich odvozených diferenciačních mutant. Jako komplementární techniku použijeme vysokorozlišovací dvoj-rozměrnou elektroforézu proteinů v kombinaci s počítačovou analýzou obrazu, která umožní měření hladiny tzv. 'global error' v průběhu vývoje streptomycet. Paralelně budeme studovat vliv modifikací ribosomů na jejich přesnost. Zaměříme se na vliv metylace rRNA, vedoucí k rezistenci na makrolidová antibiotika, na nonsense supresi UGA stop kodonu umístěného v proximální části B genu bakteriální luciferázy. Stejná měření pak provedeme s translační fúzí obou luciferázových genů, která posune UGA stop kodon do střední části fúze při zachování identického kontextu. Toto nám umožní sledovat vliv pozice stop signálu na jeho supresi. Expresi luciferáz
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Přínos řešení tohoto projektu je zejména ve vypracování zcela nového metodického přístupu umožňujícího analyzovat biochemický a morfologický průběh diferenciace u vláknitých prokaryot - streptomycet - včetně měření přesnosti translace v jednotlivých fází
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
1,277 thou. CZK
Public financial support
1,072 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK