Development of systems for searching and analysis of regulated promoters from Corynebacterium glutamicum
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj systémů pro vyhledávání a analýzu regulovatelných promotorů Corynebacterium glutamicum
Annotation in Czech
Efektivní a koordinovaná exprese genů biosyntetických drah je nezbytnou podmínkou pro cílený metabolický design produkčních kmenů aminokyselin. Jedním z hlavních prostředků je využití silných, ale za požadovaných podmínek dobře regulovatelných promotorů.Cílem této práce je identifikace promotorů aminokyselinového producenta Corynebacterium glutamicum, které podléhají regulaci během různých stresových podmínek (změna teploty, osmotického tlaku, pH). Nejprve budou sestrojeny nové nízkokopiové vektory,kterbudou použity pro vytvoření DNA-knihovny a jako sondy pro vyhledávání promotorů. Jako reportérové geny budou testovány geny lacZ, gfp a cat, které kódují beta-galactosidasu, green fluorescent protein a chloramfenokolacetyltransferasu. Důraz bude kladen na vývoj systému, který umožnil účinnou detekci fragmentů DNA vykazujících indukovanou promotorovou aktivitu během testovaných stresových podmínek. K vývoji a testování tohoto systému budou použity některé regulované promotory z C. glutamicum. Takto sest
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Grant trval 4 měsíce a je předčasně ukončen z důvodu nástupu řešitelky na mateřskou dovolenou. Údaje řešitelky jsou korektní a úplné. Význam projektu je v tom, že je součástí širšího badatelského programu pracoviště. Byl získán materiál pro konstrukci ní
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2003
Project status
S - Stopped (prematurely terminated) multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
76 thou. CZK
Public financial support
76 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK