The mechanism whereby the novel coactivator SNW regulates gene expression
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Mechanizmus regulace genové exprese novým typem koaktivátoru SNW
Annotation in Czech
Protein SNW je koaktivátorem/koregulátorem transkripčních faktorů CBF1, Smad3, NotchIC a rodiny receptorů steroidních hormonů včetně receptoru pro vitamin D. SNW kompetuje s onkoproteinem Ski o vazebne místo na transkripčních faktorech Smad. Mechanismuspůsobení SNW není dosud znám. My jsme zjistili, že SNW interaguje v S. pombe s jedním z auxiliárních faktorů sestřihu a v D. discoideum s novým typem peptidyl-prolyl cis-trans isomerasy. To naznačuje zajímavou možnost, že SNW přivádí sestřihový aparát aisomerázovou aktivitu k místu probíhající transkripce. Navrhujeme použít genetické a biochemické postupy a rovněž fluorescenční mikroskopii in vivo k funkčnímu mapování primární struktury proteinu SNW a k důkazu jeho účasti v propojení přepisu a sestřihumRNA. Ke genetické analýze použijeme komplementaci delece genu SNW v S. pombe mutantními verzemi, generovanými cílenou mutagenezí. Dále budeme testovat dopad snížení produkce SNW na sestřih a expresi reporterových genů. Biochemickou analýzu v D.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project generated novel findings on Prp45/SNW/SKIP, the essential and evolutionarily conserved transcription co-regulator, which seems to be important for regulating cell proliferation during both development and cancer. SNW proteins were found inclu
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
4,855 thou. CZK
Public financial support
3,055 thou. CZK
Other public sources
1,800 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK