All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

The mechanism whereby the novel coactivator SNW regulates gene expression

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

  • Main participants

    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

Alternative language

  • Project name in Czech

    Mechanizmus regulace genové exprese novým typem koaktivátoru SNW

  • Annotation in Czech

    Protein SNW je koaktivátorem/koregulátorem transkripčních faktorů CBF1, Smad3, NotchIC a rodiny receptorů steroidních hormonů včetně receptoru pro vitamin D. SNW kompetuje s onkoproteinem Ski o vazebne místo na transkripčních faktorech Smad. Mechanismuspůsobení SNW není dosud znám. My jsme zjistili, že SNW interaguje v S. pombe s jedním z auxiliárních faktorů sestřihu a v D. discoideum s novým typem peptidyl-prolyl cis-trans isomerasy. To naznačuje zajímavou možnost, že SNW přivádí sestřihový aparát aisomerázovou aktivitu k místu probíhající transkripce. Navrhujeme použít genetické a biochemické postupy a rovněž fluorescenční mikroskopii in vivo k funkčnímu mapování primární struktury proteinu SNW a k důkazu jeho účasti v propojení přepisu a sestřihumRNA. Ke genetické analýze použijeme komplementaci delece genu SNW v S. pombe mutantními verzemi, generovanými cílenou mutagenezí. Dále budeme testovat dopad snížení produkce SNW na sestřih a expresi reporterových genů. Biochemickou analýzu v D.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The project generated novel findings on Prp45/SNW/SKIP, the essential and evolutionarily conserved transcription co-regulator, which seems to be important for regulating cell proliferation during both development and cancer. SNW proteins were found inclu

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2002

  • Realization period - end

    Jan 1, 2004

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

  • Data delivery date

    Jun 2, 2008

Finance

  • Total approved costs

    4,855 thou. CZK

  • Public financial support

    3,055 thou. CZK

  • Other public sources

    1,800 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK