Sequence organization and evolution of plant satellite DNA
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a evoluce satelitní DNA rostlin
Annotation in Czech
Vysoce repetitivní, tandemově uspořádané sekvence DNA (tzv. satelitní DNA) se vyskytují u většiny eukaryot a zaujímají značnou část jejich genomů. I přes toto rozšíření jsou však jednou z nejméně prozkoumaných složek genetické informace živočichů a rostlin, včetně modelových organizmů vybraných pro projekty sekvenování genomů. Právě oblasti obsahující satelitní DNA totiž tvoří většinu nedokončených úseků v genomových projektech, a to z důvodu jejich specifického uspořádání, které znesnadňuje analýzu konvenčními postupy. Tento projekt bude proto zaměřen na detailní analýzu několika modelových rodin satelitní DNA pomocí kombinace moderních molekulárních a cytogenetických metod, které by měly přinést nová data potřebná k objasnění prozatím neznámých mechanizmů evoluce satelitních repetic a jejich případné funkce v genomů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project resulted in sequence variability characterization of selected satellite repeats and provided novel insights into their evolutionary patterns within and between different plant species. These data were complemented by investigating genomic org
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
5,471 thou. CZK
Public financial support
3,585 thou. CZK
Other public sources
2,830 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK