Expression of lincomycin biosynthetic gene cluster and its regulation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/05/0616
Alternative language
Project name in Czech
Exprese genů biosyntetického shluku linkomycinu a její regulace
Annotation in Czech
V navrhovaném projektu bude zjišťována organizace transkripčních jednotek a přesná místa počátků transkripce v biosyntetickém shluku linkomycinu. Na základě předchozích výsledků, tzn. znalosti uspořádání genů biosyntézy linkomycinu a částečné znalosti jeho biosyntetické dráhy, byly vytipovány možné regulační geny. Tyto geny budou jednak inaktivovány, jednak bude zvýšována jejich genová dose. Bude sledován vliv těchto zásahů na produkci linkomycinu. K základním metodám navrhovaného projektu patří příprava kosmidové knihovny, inaktivace genů, určení místa počátku transkripce (primer extension), příprava značené cDNA, a hybridizace (microarray). Očekávaným výsledkem projektu je určení regulačních genů linkomycinového biosyntetického shluku a zjištění, jakým způsobem ovlivňují expresi jednotlivých genů shluku a produkci antibiotika. Poznatky o dráhově specifických regulátorech a organizaci transkripčních jednotek umožní cílené manipulace biosyntetické dráhy linkomycinu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
HPLC methods for accurate determination of low quantities of products (lincomycin A and B) and intermediates (4-propyl-L-proline, methylthiolinkosamide, N-demethyl linkomycin and L-DOPA) of the lincomycin biosynthesis were elaborated. The methods were va
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
2,466 thou. CZK
Public financial support
2,466 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK