Genes determining critical steps in designing the producers of hybrid lincosamide antibiotics
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 8 (SAV02008-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA500200810
Alternative language
Project name in Czech
Geny určující kritické kroky přípravy producentů hybridních antibiotik na bázi linkosamidů
Annotation in Czech
Projekt bude zaměřen na dořešení těchto zjištění: 1. Byla nalezena vysoká variabilita homologních genů pro syntézu prolinové stavební jednotky nejen mezi producenty linkomycinu a anthramycinových antibiotik, ale i uvnitř skupiny anthramycinů. Aby bylo možno vyhledávat příbuzné geny v přírodním prostředí, budou sekvenovány odpovídající geny širšího spektra známých shluků. 2. Byly prokázány nebo předpovězeny podjednotky N-demethyllinkomycin synthetasy (NDLS), jejíž substrátová specifita rozhoduje o schůdnosti přípravy hybridních linkosamidů. Pomocí techniky inaktivace kandidátních genů budou identifikovány geny kódující zbývající podjednotky NDLS. 3. Přenesením celého shluku genů linkomycinu do neprodukčního organismu byl linkomycin heterologně produkován. Bude ověřeno, zda dosažená nízká úroveň heterologní produkce je důsledkem limitace některým z atypických kofaktorů. Začleňování jednotlivých vytipovaných genů z biosyntézy anthramycinů bude cestou k produkci hybridních látek.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The gene cluster for porothramycin biosynthesis was characterized and a set of genes suitable for the construction of producers of lincomycin based hybrid compounds was extended. The five N-demethylsynthetase subunits were identified at the gene level.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
4,465 thou. CZK
Public financial support
4,465 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK