Nicotiana sylvestris DNA (cytosine-5) methyltransferases
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/06/1432
Alternative language
Project name in Czech
Nicotiana sylvestris DNA-(cytosin-5)-methyltransferásy
Annotation in Czech
Nedávno se naše laboratoř pokusila identifikovat cDNA sekvence rostlinných DNA-(cytosin-5)-methyltransferás u Nicotiana sylvestris. Byly získány klony s částečnými sekvencemi METI, CMT a DRM genů kódujících všechny tři hlavní podrodiny rostlinných DNA-(cytosin-5)-methyltransferás. Hlavní cíl projektu je klonovat a sekvenovat kompletní mRNA kódující METI, CMT a DRM u N. sylvestris a vložit data do veřejných nukleotidových databází. Bude měřena míra exprese v různých vývojových stádiích a pletivech.Bude odhadnut počet genů v každé podrodině methyltransferas v genomu N. sylvestris a bude studován sekvenční polymorfismus mRNA. Budou identifikovány transkripty methyltransferas u allotetraploidní rostliny Nicotiana tabacum, zda pochází z mateřského S genomu,otcovského T genomu nebo obou a zda jsou ovlivněny stresujícími podmínkami. Vybrané oblasti genů budou použity pro studium fylogeneze rodu Nicotiana ve spolupráci s laboratoří Prof. A.R. Leitch. Budou připraveny konstrukty pro transgenosu, které
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In plants, polyploidy (chromosome multiplication) often occurs in association with interspecific hybridization leading to formation of new allopolyploid species. Epigenetic processes including DNA methylation are thought to play important roles in harmon
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
1,389 thou. CZK
Public financial support
1,389 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK