Recognition and Hydration of Biomolecules.Analysis of Crystallographic Data and Computer Modeling
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Rozpoznávání a hydratace biomolekul. Analysa krystalografických dat a počítačové modelování
Annotation in Czech
Cílem projektu je pochopit, jak rozpoznávání biomolekul, nukleových kyselin a proteinů, závisí na jejich hydrataci. Rozpoznání biomolekul je klíčovým krokem většiny biologických dějů, ale jeho molekulární podstata není plně pochopena. Proces rozpoznávánímolekul začíná setkáním jejich hydratačních obalů. Hydratační obal biomolekul se skládá z vody, která má vlastnosti odlišné od vody ve volném objemu. Je silně vázána k povrchu biomolekul a víme, že v případě basí DNA je tato hydratační vrstva tvořena lokalisovanými hydratačními místy. Lokalisovaná hydratační místa lze očekávat i okolo dalších stavebních kamenů biomolekul, aminokyselin v proteinech a páteře DNA. Taková hydratační místa musí mít vliv na průběh rozpoznávání, jeho termodynamiku, specifitua kinetiku. V projektu určíme strukturu hydratační vrstvy a budeme modelovat interakce proteinů a nukleových kyselin s explicitním uvážením jejich hydratace. Hydratační místa budou určována v závislosti na konformaci stavebních kamenů biomolekul a rovněž
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1995
Realization period - end
Jan 1, 1997
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
410 thou. CZK
Public financial support
410 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK