Design of computer aided system for quant. anal. of data obtained from 2D electrophoretograms studying gene expression during differentiation in Streptomyces
Project goals
—
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj počítačového systému pro kvantitativní analýzu dat z dvojrozměrných elektrofotoretogramů studujících genovou expresi v průběhu diferenciace u streptomycet
Annotation in Czech
Cílem navrhovného projektu je vytvoření postupů, algoritmů a procedur pro kvantitativní analýzu dat získaných z obrazové analýzy dvourozměrných elektroretogramů, spolu s vytvořením databáze proteinů syntetizovaných během vývojového cyklu eubakterie STREPTOMYCES COELIOR. Chceme vyvinout nový přístup ke vzájemnému přiřazování skvrn v souboru gelů reprezentujících daný experiment, založený na vzájemné korelaci mezi redukovanými obrazy gelů. Soubor dat o jednotlivých skvrnách získaný z analýzy souboru elektroforetogramů bude statisticky zpracován tak , abychom získali, kvantifikovali a charakterizovali skupiny koregulovaných proteinů a globální podobnosti jednotlivých stadií růstu mokroorganismu. Změny v genové expresi spojené se syntézou antibiotik budoustudovány porovnáním databáze divokého kmenu s blokovanou syntézou antibiotik.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1995
Realization period - end
Jan 1, 1997
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,423 thou. CZK
Public financial support
1,423 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
1 423 CZK thou.
Public support
1 423 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
JC - Computer hardware and software
Solution period
01. 01. 1995 - 01. 01. 1997