Design of computer aided system for quant. anal. of data obtained from 2D electrophoretograms studying gene expression during differentiation in Streptomyces
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj počítačového systému pro kvantitativní analýzu dat z dvojrozměrných elektrofotoretogramů studujících genovou expresi v průběhu diferenciace u streptomycet
Annotation in Czech
Cílem navrhovného projektu je vytvoření postupů, algoritmů a procedur pro kvantitativní analýzu dat získaných z obrazové analýzy dvourozměrných elektroretogramů, spolu s vytvořením databáze proteinů syntetizovaných během vývojového cyklu eubakterie STREPTOMYCES COELIOR. Chceme vyvinout nový přístup ke vzájemnému přiřazování skvrn v souboru gelů reprezentujících daný experiment, založený na vzájemné korelaci mezi redukovanými obrazy gelů. Soubor dat o jednotlivých skvrnách získaný z analýzy souboru elektroforetogramů bude statisticky zpracován tak , abychom získali, kvantifikovali a charakterizovali skupiny koregulovaných proteinů a globální podobnosti jednotlivých stadií růstu mokroorganismu. Změny v genové expresi spojené se syntézou antibiotik budoustudovány porovnáním databáze divokého kmenu s blokovanou syntézou antibiotik.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
JC - Computer hardware and software
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
FR - Pharmacology and apothecary chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics<br>20206 - Computer hardware and architecture<br>30104 - Pharmacology and pharmacy
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1995
Realization period - end
Jan 1, 1997
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,423 thou. CZK
Public financial support
1,423 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK