Comformational polymorphism of model DNA molecules containing tandem repeats of trinucleotide motifs
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Konformační polymorfie modelových molekul DNA obsahujících tandémová opakování trinukleotidových motivů
Annotation in Czech
Genomy obsahují tandémová opakováni trinukleotidů CCG, CGG, CAG nebo CTG. Zvýšení počtu opakování trinukleotidu v tandemu prováyí některé genetické choroby člověka. Naše zkušenosti ukazují, že jednoduché repetivní sekvence nukleotidů vnášejí konformačnípolymorfii do DNA. Tato vlastnost může přispívat k jejich délkové nestabilitě v genomech a vzniku nemocí. V tomto projektu budeme studovat konformační polymorfii modelových oligonukleotidů obsahujísích tandémová opakování zmíněných trinukleotidů a dalších krátkých sekvencí. Pomocí spektroskopických a fotochemických metod, elektroforézy a počítačového modelování určíme typ a stabilitu jejich konformérů v závislosti na nukleotidové sekvenci, exocyklických substituentech bází, podmínkách v roytoku (pH, druh a koncentrace divalentních iontů) a početu opakování motivu v molekule. Zvláštní pozornost budeme věnovat hledání podmínek, kdy shopnost oligonukleotidu nabývat nekanonických konformací povede k destabilizaci jeho duplexu s komplementární sekvencí.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1995
Realization period - end
Jan 1, 1997
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,276 thou. CZK
Public financial support
1,276 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK