Role of DNA conformation and DNA grooves in protein - DNA recognition. Model studies.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Úloha konformace DNA a žlábků DNA v rozpoznávání DNA proteiny. Modelové studie
Annotation in Czech
Cílem projektu je přispět k objasnění pravidel, kterými se řídí specifická a selektivní vazba proteinů na DNA. Zvláštní zřetel bude věnován vlivu konformace a modifikace DNA na tvorbu komplexů. Budou syntetisovány peptidy modelující specifická vazebná místa proteinů (např. vazebný motiv bZIP proteinů) a rovněž jednodušší peptidy, u kterých předpokládáme pouze selektivní vazbu na DNA. Pomocí fyzikálně chemických a molekulárně biologických metod bude studována interakce těchto peptidů s několika řadami syntetických DNA oligonukleotidových duplexů o různé sekvenci. Oligonukleotidy obsahující nestandardní base jako součást vazebných míst budou sloužit k objasnění význam žlábků DNA při vazbě DNA s peptidy.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Výsledky dosažené při řešení projektu významně přispívají k poznání pravidel, jimiž se řídí selektivní interakce DNA s proteiny. Odborný přínos projektu je nesporný. Nejvýznamnější výsledek byl získán s využitím peptidů odpovídajících DNA-vazebnému místu
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1998
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
747 thou. CZK
Public financial support
480 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK