Interactions of tumor suppressor proteins with DNA. Roles of DNA conformation and protein modifications
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Interakce nádorově supresorových proteinů s DNA. Úlohy konformace DNA a modifikací proteinu
Annotation in Czech
Schopnost proteinu p53 vázat se na specifické sekvence DNA a na určité konformační motivy v DNA je zásadní pro funkci tohoto proteinu v regulaci transkripce i jeho transkripčně-nezávislých úloh při opravách DNA, rekombinaci atd. Ztráta DNA-vazebných funkci p53 často vede ke vzniku maligních nádorů. V tomto projektu navrhujeme zkoumat interakce p53 a dalších proteinu kontrolních míst (checkpoint) se strukturami DNA specifickými pro nadšroubovicovou DNA (na kterou se p53 váže s vysokou preferencí: Palečeket al., Oncogene 1997, 15, 2201-2209), jako jsou otevřené lokální struktury, ohyby apod. Vazebná selektivita proteinu k těmto strukturám bude studována se standardním typem p53 a s delečními mutanty (zasahujícími centrální a C-koncovou DNA vazebnou doménu p53, a jeho oligomerizační doménu) a fúzními konstrukty a homology p53 (např. protein p73). Navrhujeme studovat úlohy jednotlivých domén p53 a vliv jeho posttranslačních modifikací a vazby dalších bílkovin na N- a C- konci p53
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FD - Oncology and haematology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Results of this project contributed to the knowledge about interactions of protein p53 with DNA, in particular with respect to the DNA conformation, its topological state and damage. The p53 C-terminal domain (CTD) plays a primary role in the protein sup
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
4,448 thou. CZK
Public financial support
3,042 thou. CZK
Other public sources
1,406 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK