Structural aspects of interactions of checkpoint proteins with DNA
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní aspekty interakcí proteinů kontrolních míst (checkpoint)s DNA
Annotation in Czech
Z molekulárního hlediska je rakovina v současnosti považována za poruchu procesů zpracování informací, které zajišťují uspořádaný růst buněk ve zdravém organizmu. Těchto procesů se účastní tzv. !checkpoint proteins" ( bílkoviny kontrolních míst). mezi nimi hraje prominentní úlohu protein p53, jehož funkce je úzce spojena s jeho schopností vázat se na DNA. Nedávno jsme zjistili, že p53 se přednostně váže na nadšroubovicovou (se, supercoiled) DNA (l). V prvé části tohoto projektu navrhujeme pokusit se oobjasnění podstaty této vazby. Za tím účelem se pokusíme zjistit vazebná místa p53 v se DNA a budeme zkoumat vliv podmínek prostředí jako jsou ionty kovů, oxidační činidla, teplota atd. na konformaci "divokého" proteinu (wild type) p53 a na jeho interakcssc DNA i s lineárními fragmenty DNA. Kromě metod obvykle používaných při studiu p53, hodláme použít i kapilární elektroforézu, rastrovací silovou mikroskopii a metody elektrochemické analýzy, které k tomuto účelu nebyly dosud využity. V druhé části pro
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FD - Oncology and haematology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Řešení projektu přineslo nové poznatky o sekvenčně specifické vazbě proteinu p53 na DNA. Protože regulace schopnosti p53 vázat se na DNA může představovat jeden z možných mechanismů, kterými je ovlivňována aktivita tohoto proteinu in vivo, jedná se o atr
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Data delivery date
Apr 1, 2003
Finance
Total approved costs
4,366 thou. CZK
Public financial support
3,238 thou. CZK
Other public sources
3,688 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK