Occurence of WD repeat proteins in prokaryotic cells and their possible role in a new type of regulation of gene expression in prokaryotes

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

WD-repetitivní proteiny v prokaryotické buňce a jejich předpokládaná úloha v novém typu regulace genové exprese

Annotation in Czech

Wd-repeat proteiny nesoucí 4-8 opakujících se motivů konservovaných aminokyselin byly dosud nacházeny jen v prokaryotických buňkách. U žádného z nich nebyla nalezena enzymová aktivita. Nedávno jsme dokončili sekvenci genu pkw1 isolovaného z thermofilní bakterie Thermomonospora curvat a. Na C-konci dedukované sekvence proteinu jsme našli typickou WD-strukturu. Je to první nález genu kódujícího WD-repeat protein v prokaryotech. Odvozený Pkw1 protein na svém N-konci obsahuje všech 11 konsensus domén Ser/Thr protein kinázy.V molekule Pkw1 jsme tedy nalezli dosud unikátní spojení WD-repetitivních sekvencí a enzymové domény. Rolí WD-repeat proteinů v eukaryotech je vytvářet s dalšími proteiny heteromerní regulační komplex. Nález WD-repeat protein kódujícíhogenu v prokaryotické buňce může znamenat existenci nového regulačního mechanismu v prokaryotech. Chceme využít priority isolace WD-repeat protein kódujícího genu k hledání tohoto regulačního mechanismu, který může hrát významnou roli v globální regulaci

R&D category

—

CEP classification - main branch

EE - Microbiology, virology

CEP - secondary branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

Projekt se týkal rozvíjení prioritního objevu řešitelů o přítomnosti WD proteinů u prokaryont. Příslušné geny byly izolovány, sekventovány a výsledky zaslány do světových databází. Vzhledem k tomu, že již v minulém hodnocení byl autorům vytýkán nedostate

Realization period - beginning

Jan 1, 1996

Realization period - end

Jan 1, 1998

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6

Data delivery date

—

Total approved costs

2,038 thou. CZK

Public financial support

1,624 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK