Structure and dynamics of high and low affinity ATP binding sites of Na+/K+-ATPase

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Nízko- a vysokoafinní místa pro ATP na Na+/K+-ATPáze: jejich lokalizace, struktura a dynamika

Annotation in Czech

Na+/K+-ATPáza má dvě ATP vazebná místa, která během katalýzy kooperují negativně na substráty ATP, pozitivně však s MANT-ATP. Vysokoafinní místo pro ATP (E1ATP místo) může být modifikováno fluorescein isothiokyanátem (FITC) kovalentně vázaným na lysin 501. Z poznatků poslední doby je známo, že E2ATP (nízkofinní místo) může být modifikováno kovalentně vázaným erytrosinem isothiokyanátem (ErITC). Zjistili jsme, že na E2ATP vazebné místo se s vysokou afinitou váže také DANS-8-N3-ATP. Díky světelné citlivosti vazby tohoto ATP analogu je možné E2ATP vazebné místo označit dvěmi různými fluorescenčními značkami, což nám, mimo jiné, umožní: 1) Lokalizovat aminokyselinové sekvence tvořící E2ATP vazebné místo. 2) Určit, pomocí Försterova přenosu energie,vzdálenost dvou ATP vazebných míst. Odpověď na tyto dvě otázky je hlavním cílem této práce.

R&D category

—

CEP classification - main branch

EE - Microbiology, virology

CEP - secondary branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

Projekt představuje špičkový výzkum molekulární biologie a biochemie. Získané výsledky jsou v souladu s plány grantového projektu a zasahují do celé řady biologických oborů. Řešení grantu je zakončeno 12 publikacemi (10 již vyšlo, 2 přijaté do tisku). Fo

Realization period - beginning

Jan 1, 1998

Realization period - end

Jan 1, 2000

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4

Data delivery date

—

Total approved costs

1,111 thou. CZK

Public financial support

916 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK