Viral RNA modifications
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 2 (SGA0201600002)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-16358Y
Alternative language
Project name in Czech
Virové RNA modifikace
Annotation in Czech
Metody pro citlivou analýzu RNA modifikací umožňující detailní studie chemické struktury různých RNA molekul byly vyvinuty velmi nedávno a ještě nikdy nebyly využity pro analýzu virové RNA. Nedávný objev nikotinadenindinukleotidu (NAD) kovalentně vázaného na jeden typ RNA kódované na plasmidu, naznačuje, že i další episomy jako je herpesvirus, adenovirus nebo dokonce další jednoduché formy života mohou pro nějaké účely využívat RNA molekuly s kovalentně vázanými kofaktory nebo jinými konjugáty. Cílem tohoto projektu je detailní studie chemické struktury virové RNA savčích virů pomocí hmotnostní spektrometrie. Po detekci jakékoliv modifikace nebo RNA konjugátu, nové chemické nebo chemo-enzymové metody pro identifikaci sekvence modifikovaných RNA budou využity nebo vyvinuty v závislosti na charakteru modifikace. Následným cílem bude odhalení funkce, biogenese a mechanismu interakce virové RNA s hostitelskou buňkou. Tento projekt přinese nový pohled na mechanismus účinku různých virových RNA v hostitelských buňkách.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
Dr. Cahova decided to terminate this GACR grant due to overlap with a newly awarded ERC CZ grant. She was a part of the first year of this grant on maternity leave. Using LC-MS approach, Dr. Cahova identified two types of viral RNA modifications, m1A a Ap4A/5A. The data were presented at four conferences (lectures and posters).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jan 19, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GJ-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
3,895 thou. CZK
Public financial support
3,895 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK