GTP-binding proteins and signals participating in plant cell morphogenesis
Project goals
The small GTP-binding proteins of the Rho subfamily (Rho, Rac and Cdc42 homologues) together with their protein co-factors have a central role in determining the shape of fungal and animal cells. Their homologues in higher plants have been only poorly characterized so far, and no plant proteins interacting with Rho-like GTPases are known. We have previously identified a Rho homologue expressed in the tobacco (Nicotiana tabacum) pollen. We plan to find plant proteins interacting with this Rho-like GTPase, using in vitro (biochemical) techniques, PCR and a genetic screen based on a 'semi-artificial' yeast 2-hybrid systém. We hope that at least one of these approaches will lead to the identification of proteins or cDNAs that should represent genuineplantco-factors of Rho-like GTPases and that will be further characterized.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
GTP-vazebné proteiny a signály účastnící se buněčné morfogeneze rostlin
Annotation in Czech
Malé GTP-vazebné proteiny z rodiny Rho (t.j. příbuzné s Rho, Rac nebo Cdc42) spolu s dalšími integrujícími proteiny hrají ústřední úlohu v určení tavru jak živočišných, tak houbových buněk. U vyšších rostlin je však o těchto proteinech známo velice málo;nejsou například známy žádné bílkoviny interagující s GTPázami podobnými Rho. Naše skupina nedávno identifikovala GTPázu příbuznou Rho, která je exprimována v pylu tabáku (Nicotiana tabacum). Máme v úmyslu soustředit se na vyhledávání rostlinných proteinintegrujících s touto GTPázou a to jak biochemickými metodami in vitro, tak i pomocí PCR a za použití genetických technik v semi-artificielním kvasinkovém '2-hybrid' systému. Doufáme, že alespoň jednou z těchto technik nalezneme proteiny nebo cDNA, kterébudou představovat skutečné rostlinné homology GTPáz z rodiny Rho a které budou moci být dále charakterizovány.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Řešená problematika je velmi aktuální. Zejména syntéza GTPazy NtRop1 z tabáku v bakteriálním expresním systému a její využití pro identifikaci interagujících proteinů představují kvalitní prioritní výsledky. Údaje řešitelky v Zvěrečné kartě projektu jsou
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1998
Realization period - end
Jan 1, 2000
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,800 thou. CZK
Public financial support
1,331 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
1 800 CZK thou.
Public support
1 331 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EA - Morphology and cytology
Solution period
01. 01. 1998 - 01. 01. 2000