Rab GTPases and their regulators in plant cell secretion
Project goals
We propose to continue our research into the function of small Rab GTPases and theirtwo selected regulatory protiens - Rab GDP dissociation inhibitor (RabGDI - we cloned Arabidopsis homologue via yeast mutant complementation) and Rab escort protein (REP- plant homologue was not yet cloned) - in vesicle trafficking of the plant cell. We cloned cDNAs coding for small GTPases which are expressed during tobacco pollen development. We will produce antibodies directed against selected members of this group and use them to localize related proteins in tobacco pollen and in vitro cultured cells. To study the interaction of plant Rab proteins and Arabidopsis RabGDI we sill use the yeast two hybrid system. This approach will be also used in the search for otherplant proteins interacting with Rabs or GDI. In an effort to clone plant REP we will use both PCR with "conserved" primers and complementation of the yeast mutant mrs6 defective in yeast REP.
Keywords
vesicle traffickingRab GTPasesRabll localozationRab escort protein (REP)gerynylgeranyl transferase IIArabidopsis thalianamicroinjection
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Rab GTPázy a jejich regulátory v sekreci rostlinné buňky
Annotation in Czech
Navrhujeme další pokrqčování našeho výzkumu funkce malých GTPáz z rodiny Rab bílkovin a jejich dvou vybraných regulátorů - Rab GDP disociačního inhibitoru (RabGDI - který jsme klonovali pomocí komplementace kvasinkové mutace) a Rab escort proteinu (REP -rostlinný homolog dosud není charakterizován) - v řízení provozu membránových váčků v rostlinné buňce. Klonovali jsme cDNA kódující řadu malých GTPáz exprimovaných během vývoje pylu tabáku, proti vybraným zástupcům chceme připravit protilátky a analyzovat lokalizaci příslušných GTPáz v pylu a buněčných kulturách in vitro. Ke studiu interakce rostlinných Rab proteinů a námi charakterizovaného RabGDI využijeme dvouhybridní systém v kvasinkách. Ten bude také sloužit k vyhledávání dalších možných interagujících proteinů. K hledání rostlinného REP použijeme, vedle PCR s "konzervativními" primery, komplemetaci kvasničného ts mutanta mrs6, který má poškozený kvasničný REP.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Byl charakterizován jeden z klíč. regulátorů rostl. Rab GTPáz- Rab scort protein (REP) z Arabidopsis. Mikroinjekce GTP/GDP analogů do polarizovaně rostoucích pylových láček prokázala, že GTPázy se podílejí na regulaci polarity rostl. buněk.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/AV0/AV02IA/U/N/7:3
Data delivery date
Jan 15, 2007
Finance
Total approved costs
4,565 thou. CZK
Public financial support
2,248 thou. CZK
Other public sources
2,237 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 565 CZK thou.
Public support
2 248 CZK thou.
49%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EA - Morphology and cytology
Solution period
01. 01. 1999 - 01. 01. 2001