Barriers to gene flow for different parts of the mouse genome: an analysis of a house mouse hybrid zone with microsatellites, SINEs, and SNPs
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Bariéry toku genů pro různé části myšího genomu: analýza hybridní zóny domácích myší pomocí mikrosatelitů, SINE a SNP
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt je zaměřen na využití mikrosatelitů, SINE inzercí a polymorfismu typu SNP (single nucleotide polymorphism) při genetickém mapování hybridní zóny mezi dvěma druhy myší, Mus musculus a M. domesticus. Cíle projektu jsou soustředěny nařešení následujících otázek: Jak silnou bariérou je hybridní zóna pro tok genů mezi oběma taxony v různých částech myšího genomu? Do jaké míry jsou volně žijící populace myší strukturovány? Jak velká je disperze jednotlivých myší? Pro řešení těchtoproblémů budou použity molekulární markery mapující především ty oblasti, o kterých se předpokládá, že hrají roli jakožto bariéry toku genů mezi oběma taxony myší (Hst1 na chr. 17, HstX na chr. X, t haplotyp, distální část chr. 19), doplněné o některédalší autozomální oblasti. Přestože myší genom patří k nejlépe prostudovaným mezi živočichy, studie v tomto rozsahu a zaměření dosud nejsou známy: 1. Přes množství studií věnovaných genům myší samčí sterility a t haplotypu, studie volně žijících myší z
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In total, more than 2000 mice were genetically analyzed from 128 sites scattered trhrough a 130x40 km transect across the mouse hybrid zone in W Bohemia and E Bavaria. Using a set of microsatellites the degree to which mouse populations are structured an
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
5,293 thou. CZK
Public financial support
2,616 thou. CZK
Other public sources
2,677 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK