Molecular systematics of the Ceratostomella complex and similar pyrenomycetous fungi
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
206/06/1806
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární systematika Ceratostomella-komplex a příbuzných peritheciálních askomycetů
Annotation in Czech
Náplní je fylogenetická a revizní studie Ceratostomella, Ceratosphaeria a Lentomitella, tzv. Ceratostomella-komplex, a podobných pyrenomycetů. Tyto rody jsou důležitou složkou biodiverzity rostlinné hmoty a významně se podílejí na její dekompozici. Přesto nejsou známy fylogenetické studie o jejich skutečných vztazích, není známo nic o jejich životních cyklech a konidiogenezi. Uvedené rody obsahují taxony, které jsou modelové organismy pro studium a dokumentaci procesu konvergence u peritheciálních askomycetů. Předkládaný projekt je založen na morfologických, kultivačních a molekulárních studiích (PCR, druhově specifické primery, sekvenování genů pro 18S a 28S nuc-rDNA, modely sekundárních struktur RNA) a na metodách fylogenetické analýzy dat. Podstatnou částí výzkumu je získání molekulárních dat z kultur typových a dalších druhů izolovaných z čerstvě sebraného materiálu. Projekt je navržen tak, aby řešil systematické a fylogenetické otázky před nimiž dnes stojí systematika askomycetů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The phylogenetic analyses based on a single gene 28S rRNA are the first insights into the evolutionary history of the Ceratostomella complex. They show the complex diverging into 7 different ancestral lineages. A milestone in understanding the phylogenet
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
2,095 thou. CZK
Public financial support
2,095 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK