Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS) to Identify Unknown Metabolites Detected by Untargeted Metabolomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202100005
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
21-00477S
Alternative language
Project name in Czech
Vodík-deuteriová výměna ve spojení s hmotnostní spektrometrií (HDX-MS) k identifikaci neznámých metabolitů detekovaných necílenou metabolomikou
Annotation in Czech
Necílená metabolomika se zaměřuje na analýzu všech detekovatelných metabolitů ve vzorku. Metabolomika využívající kapalinovou chromatografii s hmotnostní spektrometrií (LC-MS) generuje tisíce signálů (molecular features) v biologických vzorcích během jedné analýzy charakterizovaných retenčním časem a hodnotou m/z. Pouze 10 % těchto signálů je možno obvykle anotovat a zbývající detekované signály představují „neznámé“ sloučeniny. Jeden z nejnáročnějších aspektů metabolomiky tudíž představuje identifikace „neznámých“ metabolitů. Bude testována hypotéza, že vodík-deuteriová výměna ve spojení s hmotnostní spektrometrií (HDX-MS) dramaticky zlepší identifikaci signálů z necílené metabolomiky, což povede k novým poznatkům nutných k interpretaci metabolomických dat. Za tímto účelem bude provedena optimalizace LC-HDX-MS platforem pro profilování polárních metabolitů a komplexních lipidů. Následně budou tyto platformy použity k identifikaci nových metabolitů ve slepém střevě, výkalech a plazmě myší po úpravě střevní mikrobioty pomocí diety, antibiotik a probiotik.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation<br>CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
—
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
6,961 thou. CZK
Public financial support
6,961 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK