New alkyl chloroformate labeling strategies for the targeted and comparative mass spectrometry-based metabolomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-18509S
Alternative language
Project name in Czech
Nové strategie značení alkylchlorformiáty pro cílenou a srovnávací metabolomiku technikami hmotnostní spektrometrie
Annotation in Czech
Hlavním cílem projektu je studium nových postupů značení metabolitů alkylchlorformiáty nesoucími stabilní izotopy a jejich aplikace pro cílenou a srovnávací metabolomiku technikami hmotnostní spektrometrie. Výzkum bude směřován k řešení hlavních problémů současné metabolomiky: (i) Identifikace metabolitů v komplexních biologických matricích po jednoduché přípravě vzorku pomocí chlorformiátového činidla obsahujícího stabilní izotopy; (ii) Značení metabolitů pro účely srovnávací (diferenční) metabolomiky, umožňující přímé srovnání kontrol a terčových vzorků; (iii) Hledání nových způsobů kvantitativní analýzy metabolitů v komplexním biologickém materiálu přímým srovnáním MS signálů známého množství standardu metabolitu, předznačeného chlorformiátem se stabilními izotopy, s analytem obsaženým ve vzorku a značeným přírodním činidlem; (iv) Izotopomerová analýza a její využítí při studiu metabolických drah a metabolických toků.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CC - Organic chemistry
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project deals with preparation of new chloroformate labeling by stable isotope of deuterium and carbon and application of this method for the metabolomic research. This labeling allowed research of reaction mechanism of carboxylic group esterification and unambiguous identification of reaction products more than 250 protic metabolites. This method is suitable for biological and clinic research.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Nov 24, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
5,145 thou. CZK
Public financial support
5,145 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK