Complex automation of metabolomic analysis of biological samples
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
Programme of applied research and experimental development ALFA
Call for proposals
ALFA 4 (STA02014TA04)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
2014TA04011751
Alternative language
Project name in Czech
Komplexní automatizace metabolomické analýzy biologických vzorků
Annotation in Czech
Předkládaný projekt je zaměřen na výzkum a vývoj originální technologie pro plně automatizovanou analýzu nízkomolekulárních látek v biologických materiálech. Cílem projektu je vyvinout komplexní nástroj pro metabolomickou analýzu, který započne vložením nádobky se vzorkem biologické tekutiny či extraktu tkáně do robotického zařízení a jeho následné, plně automatické zpracování a analýza vzorků. Příprava vzorků bude plně integrována se standardizovanou kolonovou separací látek se spojení s hmotnostně spektrometrickou detekcí a následným plně automatickým zpracováním/vytěžováním dat a vyhodnocením složení vzorků. Celý proces tak bude probíhat plně automaticky. Pro úspěšnou realizaci bude navrženo a zkonstruováno robotické zařízení integrované s dávkovačem vzorků a zkoumána řešení, jak integrovat a naprogramovat veškeré operace se vzorky, počínaje mícháním, centrifugací, transfery médií a látek, značkováním metabolitů novými originálními činidly, činidly značenými stabilními izotopy až po odpařování, ředění extraktů a odtah par rozpouštědel. Data naměřená na standardních přístrojích budou zpracována a vytěžována pomocí vyvíjené platformy Metabolite Mapper, která umožní automatické exportování vytěžených dat do standardních formátů a jejich zpracování pomocí běžně dostupných statistických nástrojů. Úspěšné dosažení cílů projektu bude vyžadovat komplexní přístup a úzkou spolupráci odborníků základního výzkumu s odborníky na mechanické a automatizované systémy, softwarové inženýrství, informační technologie, až po komunikaci s odborníky na systémy řízení jakosti (QC) a potenciálními zákazníky. Realizace projektu umožní vytvořit nové automatizované nástroje k efektivnímu mapování látek a poznání vlastností biologických materiálů na kvalitativně nové úrovni, což vše přispěje k dosažení hlavního cíle programu ALFA.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
CEP - secondary branch
JD - Use of computers, robotics and its application
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The solution contributed to the program's goal with new results suitable for further testing and validation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2014
Realization period - end
Jul 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 28, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP18-TA0-TA-U/16:1
Data delivery date
Nov 6, 2018
Finance
Total approved costs
9,617 thou. CZK
Public financial support
6,248 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
3,369 thou. CZK