All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Complex automation of metabolomic analysis of biological samples

Public support

  • Provider

    Technology Agency of the Czech Republic

  • Programme

    Programme of applied research and experimental development ALFA

  • Call for proposals

    ALFA 4 (STA02014TA04)

  • Main participants

    Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    2014TA04011751

Alternative language

  • Project name in Czech

    Komplexní automatizace metabolomické analýzy biologických vzorků

  • Annotation in Czech

    Předkládaný projekt je zaměřen na výzkum a vývoj originální technologie pro plně automatizovanou analýzu nízkomolekulárních látek v biologických materiálech. Cílem projektu je vyvinout komplexní nástroj pro metabolomickou analýzu, který započne vložením nádobky se vzorkem biologické tekutiny či extraktu tkáně do robotického zařízení a jeho následné, plně automatické zpracování a analýza vzorků. Příprava vzorků bude plně integrována se standardizovanou kolonovou separací látek se spojení s hmotnostně spektrometrickou detekcí a následným plně automatickým zpracováním/vytěžováním dat a vyhodnocením složení vzorků. Celý proces tak bude probíhat plně automaticky. Pro úspěšnou realizaci bude navrženo a zkonstruováno robotické zařízení integrované s dávkovačem vzorků a zkoumána řešení, jak integrovat a naprogramovat veškeré operace se vzorky, počínaje mícháním, centrifugací, transfery médií a látek, značkováním metabolitů novými originálními činidly, činidly značenými stabilními izotopy až po odpařování, ředění extraktů a odtah par rozpouštědel. Data naměřená na standardních přístrojích budou zpracována a vytěžována pomocí vyvíjené platformy Metabolite Mapper, která umožní automatické exportování vytěžených dat do standardních formátů a jejich zpracování pomocí běžně dostupných statistických nástrojů. Úspěšné dosažení cílů projektu bude vyžadovat komplexní přístup a úzkou spolupráci odborníků základního výzkumu s odborníky na mechanické a automatizované systémy, softwarové inženýrství, informační technologie, až po komunikaci s odborníky na systémy řízení jakosti (QC) a potenciálními zákazníky. Realizace projektu umožní vytvořit nové automatizované nástroje k efektivnímu mapování látek a poznání vlastností biologických materiálů na kvalitativně nové úrovni, což vše přispěje k dosažení hlavního cíle programu ALFA.

Scientific branches

  • R&D category

    AP - Applied research

  • CEP classification - main branch

    FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition

  • CEP - secondary branch

    JD - Use of computers, robotics and its application

  • CEP - another secondary branch

    CE - Biochemistry

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The solution contributed to the program's goal with new results suitable for further testing and validation.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jul 1, 2014

  • Realization period - end

    Jul 31, 2017

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Feb 28, 2017

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

  • Data delivery code

    CEP18-TA0-TA-U/16:1

  • Data delivery date

    Nov 6, 2018

Finance

  • Total approved costs

    9,617 thou. CZK

  • Public financial support

    6,248 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    3,369 thou. CZK