System analysis of functional interactions of human RNA demethylases
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-12871S
Alternative language
Project name in Czech
Systémová analýza funkčních interakcí lidských demetyláz RNA
Annotation in Czech
Modifikace RNA jsou jedním z klíčových mechanismů regulace genové exprese. N6-methyladenosine (m6A) a N6,2′-O‐dimethyladenosine (m6Am) jsou nejčetnější modifikace RNA, důležité v mnoha aspektech biologie RNA, vývoje organismu, odpovědi na stress či v onemocnění. Tato dráha zahrnuje klíčové hráče tzv. “writers”, “readers” a “erasers”. Koncept reverzibility těchto modifikací tak představuje zajímavý nástroj pro vylaďování buněčného metabolismu. Savčí buňky kódují dvě adenosinové demetylázy FTO a ALKBH5, které hrají roli v metabolismu mRNA a jejich aktivita je důležitá v embryogenezi, vývoji, či onemocnění. Navzdory intenzivnímu výzkumu v tomto oboru, zůstává mechanismus a regulace FTO a ALKBH5 z velké části neznámá. Za použití kombinace systémových a detailních funkčních studií se zaměříme na odhalení mechanismů regulace těchto demetyláz, přesné identifikace jejich RNA targetů a jejich funkční provázanosti s dalšími buněčnými drahami.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 7, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
10,857 thou. CZK
Public financial support
10,857 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK