All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Characterization of the RNA substrate repertoire of the human demethylase FTO

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

  • Main participants

    Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    14-25884S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Charakterizace substrátového repertoáru RNA lidské demetylázy FTO

  • Annotation in Czech

    Eukaryotické RNA podstupují celou řadu modifikací bazí. Některé z nich jsou důležité pro strukturu, mezimolekulární interakce či aktivitu RNA. Nejčastější modifikací eukaryotické mRNA je teprve nedávno odhalená metylace adenosinového N6 rezidua (m6A). Přes její častý výskyt, není úloha m6A zatím přesně známa. Bylo ukázáno, že dekorace RNA přes m6A je dynamický proces, což naznačuje jeho důležitost pro regulační pochody. Savčí buňky mají dvě demetylázy, FTO a AlkBH5, které dokáží odstranit m6A. FTO je medicínsky významný protein, pro jeho vazbu na vývoj obezity u lidí. Přes intenzivní pozornost věnovanou FTO, není doposud známo, jaké RNA procesuje a jaká je přesně jeho funkce na molekulární úrovni. Naším cílem je ocharakterizovat fyziologické substráty RNA pro FTO a pomocí proteomických studií zjistit úlohu m6A modifikace v regulaci genové exprese. Naše výsledky významně rozšíří znalosti o úloze m6A v metabolismu RNA a roli FTO v buněčné regulaci.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    Project resulted in description of m6A RNA demethylation by FTO demethylase. It was described how FTO action modulates alternative splicing and 3' end RNA processing. Results were summarized into a publication in high ranking journal Nucleic Acids Research.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2014

  • Realization period - end

    Apr 23, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 5, 2016

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-GA0-GA-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 12, 2019

Finance

  • Total approved costs

    7,998 thou. CZK

  • Public financial support

    7,998 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK