Characterization of the RNA substrate repertoire of the human demethylase FTO
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-25884S
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace substrátového repertoáru RNA lidské demetylázy FTO
Annotation in Czech
Eukaryotické RNA podstupují celou řadu modifikací bazí. Některé z nich jsou důležité pro strukturu, mezimolekulární interakce či aktivitu RNA. Nejčastější modifikací eukaryotické mRNA je teprve nedávno odhalená metylace adenosinového N6 rezidua (m6A). Přes její častý výskyt, není úloha m6A zatím přesně známa. Bylo ukázáno, že dekorace RNA přes m6A je dynamický proces, což naznačuje jeho důležitost pro regulační pochody. Savčí buňky mají dvě demetylázy, FTO a AlkBH5, které dokáží odstranit m6A. FTO je medicínsky významný protein, pro jeho vazbu na vývoj obezity u lidí. Přes intenzivní pozornost věnovanou FTO, není doposud známo, jaké RNA procesuje a jaká je přesně jeho funkce na molekulární úrovni. Naším cílem je ocharakterizovat fyziologické substráty RNA pro FTO a pomocí proteomických studií zjistit úlohu m6A modifikace v regulaci genové exprese. Naše výsledky významně rozšíří znalosti o úloze m6A v metabolismu RNA a roli FTO v buněčné regulaci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project resulted in description of m6A RNA demethylation by FTO demethylase. It was described how FTO action modulates alternative splicing and 3' end RNA processing. Results were summarized into a publication in high ranking journal Nucleic Acids Research.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
7,998 thou. CZK
Public financial support
7,998 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK