Parabasalids as a model for study of transitions between free-living, commensalic and parasitic lifestyle
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-22538S
Alternative language
Project name in Czech
Parabasalidi jako model pro studium přechodů mezi volně žíjícím, komenzálním a parazitickým způsobem života
Annotation in Czech
Parabasala je velmi diverzifikovaná skupina prvoků, do které patří kromě známých patogenů, jakými je třeba Trichomonas vaginalis, také celá řada komenzálních a sekundárně volně žijících zástupců. Do dnešní doby byli na úrovni genomů, s pouze několika výjimkami, studováni především patogenní zástupci. V nedávné době jsme objevili dvě nové volně žijící linie, Anaeramoeba a izolát Lagos, které představují nezávislé evoluční větve bazální k parabasalidům. Parabasalidi jsou optimální modelovou skupinou pro studium přechodu mezi různými způsoby života a hostitelskými prostředími, neboť mezi ně patří řada parazitů, komenzálů a sekundárně volně žijících organismů, které jsou společně zakořeněny volně žijícími liniemi. Cílem projektu je sekvenovat transkriptomy a genomy v kombinaci proteomikou sekretovaných proteinů a proteinů lokalizovaných do buněčné membrány. Následně komparativní analýzou určit specifické genomické adaptace na různé způsoby života a hostitelské prostředí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
—
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
9,200 thou. CZK
Public financial support
9,200 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK