Development of method for membrane protein target identification of biologically active small molecules
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05642S
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj metody pro identifikaci membránových proteinových cílů biologicky aktivních látek
Annotation in Czech
Fenotypické testování často odhaluje aktivní látky (hity) s neznámým mechanismem účinku. Pro další vývoj těchto látek je potřeba identifikovat jejich cílový protein/receptor. Pro zvýšení afinity konjugátu k jeho receptoru navrhujeme připojit více molekul aktivní látky k hydrofilnímu kopolymeru nesoucímu také značící katalyzátor. Po inkubaci konjugátu s biologickým vzorkem dojde díky katalyzátoru k tvorbě radikálu z přidané aktivovatelné značky s biotinem, který kovalentně biotinyluje cílový protein. Tím bude dosaženo stabilní vazby membránového proteinu i během afinitní purifikace na streptavidinových kuličkách. Protein je následně izolován a identifikován pomocí hmotnostní spektrometrie. Tato metodika umožní efektivní identifikaci cílů malých molekul a jejich regulačních drah.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10404 - Polymer science
OECD FORD - secondary branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - another secondary branch
10609 - Biochemical research methods
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation<br>CD - Macromolecular chemistry<br>CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
8,931 thou. CZK
Public financial support
8,706 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
225 thou. CZK