Allostery and spatial organization in glycolysis: the role of phosphofructokinase 1
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-06437S
Alternative language
Project name in Czech
Alosterie a prostorová organizace v glykolýze: úloha fosfofruktokinázy 1
Annotation in Czech
Glykolýza, klíčová metabolická dráha, podléhá rozsáhlé regulaci, jejíž poruchy jsou spojovány s onemocněním. Enzym fosfofruktokináza 1 (PFK1) tvoří klíčový uzlový bod, prostřednictvím nějž je řízen tok drahou. Mechanistické porozumění této regulaci, o které se předpokládá, že zahrnuje lokalizovanou tvorbu dynamických enzymových shluků, však stále chybí. Cílem tohoto projektu je poskytnout detailní mikroskopický pohled na mechanismy, které jsou základem funkce enzymu PFK1 a jeho izoformně specifické regulace. Abychom tohoto cíle dosáhli, budeme provádět molekulární simulace PFK1 včetně jeho shluků, a to od plně atomistické až po ultra-zhrubenou úroveň. Naše simulace pomohou objasnit mechanistický původ alosterické regulace enzymu a navrhnou nové způsoby řízení tvorby jeho dynamických shluků. Práce bude důležitým krokem ve vývoji komplexního teoretického modelu glykolýzy a její dynamické nitrobuněčné organizace a regulace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10403 - Physical chemistry
OECD FORD - secondary branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics<br>CE - Biochemistry<br>CF - Physical chemistry and theoretical chemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
6,726 thou. CZK
Public financial support
6,691 thou. CZK
Other public sources
35 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK