Atomistic Understanding of Peptide Hormone Binding to Their Receptors and Mimetics Design via Advanced Computations and Experimental Verification

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

SGA0202300001

Main participants

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

23-06755S

Project name in Czech

Porozumění vazbě peptidový‎ch hormonů k jejich receptorům na atomární úrovni a návrh mimetik pomocí pokročilých vý‎počtů a experimentálního ověření

Annotation in Czech

Inzulín a jeho analogy jsou molekuly zachraňující životy pacientů s cukrovkou. Kvůli jejich problémům, např. subkutánnímu podávání či nízké stabilitě je třeba hledat nepeptidové malé molekuly s podobn‎ým účinkem, mimetika. Díky průlomům v kryoelektronové mikroskopii je k dispozici několik struktur komplexů inzulínu s receptorem (IR) v dostatečném rozlišení (3.2 Å), které lze využít k modelování a návrhu léků. V tomto projektu využijeme pokročilé metody výpočetní chemie založené na kvantové chemii a molekulové dynamice k predikci síly vazby mezi inzulínem a IR. Tyto protokoly ověříme porovnáním s experimentálními afinitami a poté je využijeme k návrhu mimetik, jejich syntéze a měření afinity k receptoru. U aktivních látek bude určena krystalová struktura a zjištěny dynamické faktory vhodné pro vazbu. Na závěr použijeme tuto metodologii též na izoformu IR-B, inzulínu podobné růstové faktory a virové peptidy podobné inzulínu.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10403 - Physical chemistry

OECD FORD - secondary branch

—

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

CF - Physical chemistry and theoretical chemistry

Realization period - beginning

Jan 1, 2023

Realization period - end

Dec 31, 2025

Project status

B - Running multi-year project

Latest support payment

Mar 27, 2023

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP24-GA0-GA-R

Data delivery date

Feb 19, 2024

Total approved costs

6,776 thou. CZK

Public financial support

6,679 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

27 thou. CZK