Interplay between genetics, ecology and symbionts in two adaptive radiations of New Guinean rodents
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-07216S
Alternative language
Project name in Czech
Interkace mezi genetikou, ekologií a symbionty ve dvou adaptivních radiacích hlodavců z Nové Guiney
Annotation in Czech
Evoluční radiace po kolonizacích nových oblastí s volnými ekologickými nikami, jsou popisovány jako adaptivní, tj., probíhající skrze ekologickou speciaci. Nicméně, alopatrické mechanismy mohou hrát rovněž roli, zvláště v topograficky rozličném prostředí. V tomto projektu se zaměříme na unikátní systém hlodavců z ostrova Nová Guinea (NG), na kterém se odehrály dvě časově oddělené radiace, po kolonizaci ostrova předky současných hlodavců tribů Hydromyini (7 mya) and Rattini (1 mya). Pomocí multidisciplinárního přístupu, spojujícího genomiku, ekologii, parazitologii a mikrobiologii, charakterizujeme a srovnáme tyto dvě radiace NG hlodavců. S využitím genomických sekvenčních dat popíšeme genetické vzorce uvnitř a mezi druhy hlodavců. Vysledujeme ko-evoluční historii symbiontů (střevní bakteriom, helminti) a jejich hostitelů z řad NG hlodavců. Tato data, spolu s daty o ekologii a geografii hlodavců, nám umožní prozkoumat mechanizmy, které stojí za diverzifikací NG hlodavců a srovnat jejich relativní vlivy ve zkoumaných radiacích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10613 - Zoology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EG - Zoology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 24, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
10,281 thou. CZK
Public financial support
10,281 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK